ゲル電気泳動 バンドサイズ推定
分子量マーカーの移動距離から検量線を作り、未知バンドのサイズ・相対移動度・電場強度を計算します。
分子量マーカーの各バンドについて、既知のサイズと実測の移動距離を入力します。
相対移動度Rfの算出に使います。
濃度が高いほど小さな断片の分離に適します。
ゲル長ではなく電極間の距離を入力します。
ゲル電気泳動 バンドサイズ推定の使い方・活用シーン
使い方
ゲル電気泳動 バンドサイズ推定は、分子量マーカーの移動距離から検量線を作り、未知バンドのサイズ・相対移動度・電場強度を計算します。画面に表示されている入力欄に必要な項目を入力し、ボタンを押すだけで結果がその場に表示されます。入力からボタン操作、結果の確認までは数秒で完結し、専門的な予備知識がなくても迷わず使えるように作られています。入力した内容がToolHubのサーバーに送信されることはなく、計算処理はすべてお使いのブラウザ内だけで完結するため、氏名や個人的な数値など、他人に見られたくない情報を扱う場面でも安心してご利用いただけます。結果に納得できない場合は、入力内容を書き換えるだけで即座に再計算されるので、条件を変えながら何度でも試すことができます。
どんなときに使うか
「化学計算」に関する作業のうち、とくに電気泳動・アガロースゲル・分子量マーカー・相対移動度に関わる場面で役立ちます。手元に電卓や表計算ソフトがないとき、あるいは毎回同じ計算式を手で入力するのが面倒なときに、このページを開くだけで済ませられるのが最大の利点です。スマートフォンからでも同じ操作でそのまま使えるため、外出先や授業・会議の合間などパソコンを開けない状況でも、必要な数値をすぐに確認できます。ブックマークしておけば、次回以降はワンクリックでこのツールに戻ってこられます。
計算の仕組み・メリット
- なぜ移動距離とサイズの対数が直線になるのですか?
- ゲルの網目構造の中をDNAがふるい分けられるように移動するため、移動距離が分子量の対数にほぼ比例して減少するためです。ただし極端に大きい・小さい断片では直線から外れます。
- アガロース濃度はどう選びますか?
- 分離したい断片サイズで決めます。大きな断片(10kb以上)には0.5〜0.7%、数百bpの小さな断片には1.5〜2.0%が適しています。
このように、計算の根拠となる考え方をあらかじめ明確にしたうえでロジックを実装しているため、表示された結果がどのような前提で導かれたのかを確認しながら安心して利用できます。また、ToolHubのツールはすべて登録不要・完全無料で、広告の表示以外の目的で個人情報を収集することはありません。気になるツールが他にもあれば、ページ上部のカテゴリーメニューや検索欄からすぐに探せます。